La Chiesa di San Donato si trova presso la frazione di Civita di Bagnoregio, di fronte all'antico palazzo comunale.

Risalente al V secolo, era l'antica cattedrale della diocesi di Bagnoregio, prima che il terremoto del 1695 costringesse a spostare la sede presso la chiesa collegiata di San Nicola a Bagnoregio.

Ancora oggi conserva tracce dell'originario impianto romanico, sebbene nel Cinquecento abbia subito notevoli modifiche, su progetto dell'architetto Nicola Matteucci di Caprarola che fece demolire la parete est, i due cori, la cripta e l'altare maggiore, per sostituirli con l'odierno presbiterio e il nuovo coro. Anche la facciata venne rimaneggiata, assumendo un aspetto rinascimentale, arricchito più tardi col portale centrale e i due laterali.

Al suo interno, a tre navate, conserva un affresco della scuola del Perugino e un crocifisso ligneo del Quattrocento, della scuola di Donatello.

Il campanile a torre incorpora alla base due sarcofagi etruschi in pietra di basalto.