Il Santuario, dedicato alla Santa protettrice di Cerreto Guidi, Santa Liberata, fu probabilmente costruito nel 1336 come ringraziamento per la liberazione della città dalle truppe di Mastino della Scala.

Al suo interno è conservato un affresco, rappresentante la 'Madonna delle Grazie tra i santi Giovanni Battista e Leonardo', databile alla fine del secolo XIV.

Nel Seicento furono ristrutturati il porticato, la sagrestia e il presbiterio, mentre l'Affresco di Santa Liberata venne coperto da una tela raffigurante Santa Faustina e San Pietro.

Nel 1798 il complesso architettonico assunse l'aspetto attuale, mentre l'elevazione dell'edificio a Santuario risale al 1966.